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默沙东BACE1抑制剂Verubecestat公斤级合成工艺再开发

有人说:Verubecestat虽然不是阿尔兹海默症治疗领域的第一个BACE1抑制剂,但却是首个进入临床Ⅲ期的BACE1抑制剂;虽然临床Ⅲ期受挫,但对BACE1抑制剂的研究具有重要意义。

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作者:云天  来源:CPhI制药在线

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Verubecestat(MK-8931,图一)是默沙东的一个新型BACE1抑制剂。现有研究发现,BACE1酶可以催化淀粉样前体蛋白(APP)分解成β-淀粉样蛋白,而β-淀粉样蛋白是构成阿尔兹海默症患者大脑老年斑的主要物质,因此被作为检测阿尔兹海默症患病程度的重要指标之一,同时也是目前老年痴呆免疫疗法的关键靶标之一。曾经,Verubecestat最为一个BACE1抑制剂,在临床Ⅰ期试验中显示能够显著降低患者脑脊液中β-淀粉样蛋白含量,且具有良好的安全性,引起了业界非常大的关注。

图一 BACE1抑制剂Verubecestat

但是,由于Verubecestat的再临床III期研究中并未让患者显示出明显的症状改善,因此止步于临床III期研究(图二)。即便如此,其工艺开发仍然具有较大价值,主要在于:1. Verubecestat的开发并未完全停止,其他适应症、衍生物合成开发正在探索;2. Verubecestat的结构中存在诸多药物分子中含有的片段,其合成工艺对其他类似小分子药物具有借鉴意义;3.其化学键的构建方法具有通用性,如C-N键、胍基环的构建方法对其他药物分子的合成具有借鉴意义。



图二 截取自Thomson数据库

图三是默沙东报道的BACE1抑制剂Verubecestat公斤级合成工艺。在该工艺中,研究人员使用原料亚胺2和磺酰胺底物3通过Mannich-type加成反应得到了手性中间体4;水解脱除亚磺酰基团后与酸成盐得到中间体5,中间体5可以与化合物6缩合得到中间体7;中间体7脱除PMB保护基后与BrCN形成胍基产物9,最后在碱性条件下游离出碱性目标产物Verubecestat。该工艺实现了Verubecestat的公斤级合成,总产率高达61%。



图三 BACE1抑制剂Verubecestat的公斤级合成工艺

(默沙东工艺)

但是,该工艺仍然存在改进空间,尤其是在中间体7的合成过程中需要使用高温(104℃),且会产生化合物10、6的水解产物11等杂质(图四),给收率和产物分离带来了较大的影响。因此,默沙东最近针对Verubecestat的合成公斤进行了再次优化改进,特别是针对中间体7的合成工艺改进。



图四 中间体7的合成

在优化过程中,研究人员首先探索了反应试剂对水解杂质11产生量的影响,结果发现,催化剂CuI的使用量对水解杂质11产生量影响较大,表现为正相关。



图五 水解杂质11形成机制探索

此外,研究人员还通过核磁(NMR)等分析方法对C-N键形成的偶联反应进行了系统研究,并根据反应结果提出了图六所示Cu离子螯合机制,并指出水解杂质11的形成是通过螯合态D而形成,而杂质11的形成则由于螯合态A的存在。通过图六我们可以看出,酰胺底物6实际上与二胺配体形成了一个竞争机制,这里的问题在于:底物6当量过大,则会通过D产生较多的水解杂质11;而二胺配体当量过大,则会通过A产生较多的杂质10。而要高产率得到目标产物7,则需要更多地以螯合太B的型式存在,因此,必须找到一个合适的当量比。



图六 Cu离子螯合机制

最后,研究人员根据以上结果和推测,通过首先让0.25当量的酰胺底物6与Cu及二胺基配体进行预处理,从而保证了酰胺底物6与二胺基配体的当量基本一致,从而可以更多的形成螯合物B。通过条件筛选,成功让啊反应温度降至100℃以下,产率也保持在90%以上(图七)。



图七 中间体7的合成条件优化

有人说:Verubecestat虽然不是阿尔兹海默症治疗领域的第一个BACE1抑制剂,但却是首个进入临床Ⅲ期的BACE1抑制剂;虽然临床Ⅲ期受挫,但对BACE1抑制剂的研究具有重要意义。在该领域,卫材旗下的Elenbecestat和罗氏旗下的Gantenerumab、Crenezumab均已进入临床开发后期。此外,此次Verubecestat的工艺开发,有利于Verubecestat的后期开发,以及对类似分子合成工艺的开发具有很大的借鉴意义。

参考文献:

1. Thomson数据库;

2. A Next Generation Synthesis of BACE1 Inhibitor Verubecestat (MK-8931),2018;

3. Improved Process for a Copper-Catalyzed C?N Coupling in the Synthesis of Verubecestat, 2019.


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来源:新浪医药

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