RT。在miRbase数据库里只能查到pre-miRNA与成熟miRNA序列,为什么没有pri-miRNA序列呢?pri-miRNA序列查找是不是在另一个数据库?
我觉得您可以从miRNA database 获取pre-miRNA序列,对pre-miRNA序列在GeneBank 上进行blast 就可以获得了,很简单的
pri-miRNA是microRNA从DNA上转录出来的初级转录本,有可能很长上Kb,如一些miRNA簇mir-17-92,有可能只有100bp左右。目前没有想pre-miRNA和成熟miRNA的数据库供检索。当然也是可以通过一些生物信息学方法去推测的,如通过组蛋白标记H3K27me进行推断,最终还是要通过5‘RACE和3'RACE去证实到底有多长的。希望能帮助到您