2021-03-07 21:31:03

如何判断药物的疏水性和进入细胞的能力?

我设计了一个药物分子,想请教一下:如何不做实验只使用一些软件就能判断它的疏水性和进入细胞的能力呢?


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5个回答

衡量药物的疏水性,logP就够了,但要是判断进入细胞的能力,光一个logP是不够的,还得看分子的大小,结构,在哪个部位进入细胞等,不是很全面,仅做参考。


2021-03-07 21:35:26

如果单纯用软件算的话, 可以从网上找一些计算polar surface area (PSA)的软件, PSA<140 的话, permerbility应该还可以的。实验方法有CACO-2细胞和PMAPA法。

2021-03-07 21:38:45

化合物进入细胞的能力,不仅与物质本身的各种理论参数(比如logP,PSA,HBA,HBD,MW等)有关,还与细胞的类型有关,比如脑部的脑微血管上皮细胞,由于血脑屏障的存在,对物质的选择性就特高,要能进入脑内,基本上要达到以下的要求才行:

PSA<80-90, Log P>0, MW<400-500, HBA≤6 & HBD≤2。而物质进入其他部位细胞的条件就没有这么严格。在这个条件下要发现有效的药物(不包括制剂手段),是很困难的,也就是说,常规的药物要进入脑内是很难的.因为根据role of 5就能否定掉很多符合上述条件的化合物来作为药物.(比如大部分药物分子量要大于500才行)。


2021-03-07 21:41:39

也要考虑到主动运输的情况, 如果有transporter的话, 就不需要这么严格的条件, 所以说理论预测只起到参考作用,还需要通过实验方法来验证。


2021-03-07 21:43:14

如果是通过被动扩散透膜的话,那么logp,PSA等是一些重要的参数,国内有chemoffice,hyperchem等软件,就具备这些数值的能力。其中chemoffice提供的clogp,你可以试试。


2021-03-07 21:44:57

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