方法很多,可以先看这两个基因的基本信息及已发表文献当中有无报道他们之间相关性或相互作用,可以上http://www.genecards.org/查询,也可以上http://www.genome.jp/kegg/查询其所在信号通路位置、关系及相互作用。如果该蛋白是转录因子,那么还可以通过以下网站预测其靶基因和结合位点,http://www.biobase-international.com/product/transcription-factor-binding-sites;http://rulai.cshl.edu/cgi-bin/TRED/tred.cgi?process=home |
预测思路:1.得到nanog的promoter序列。http://www.google.com.hk/#newwindow=1&q=promoter+database&safe=strict,2.对promoter上结合的转录因子进行预测分析。http://www.google.com.hk/#newwindow=1&q=transcription+factors+binding+prediction+&safe=strict |
在encode数据中,看看有没有相关的chip记录 http://www.plosbiology.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pbio.1001046 |
提问时间: | 2024-03-26 |
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