首先，可以从杂质的含量及去除（精制或结晶工艺）途径确定杂质在工艺路线中的传递情况，确定杂质在API中是否超过报告限；然后，通过工艺分析，推测相应结构，根据结构情况（是否有安全性问题？是否含基因毒性结构等？），确定杂质安全性；之后，根据杂质的传递情况、安全性、在API中的含量（多批次累计数据），确定是否订入中间体或API质量标准、是否需要进行结构确证。可以参考《化学药物杂质研究技术指导原则》及其他相关文件。

可以通过色谱保留时间，紫外光谱，质谱辅助验证。也只能说是有最大可能是。

换几种HPLC方法，如果出峰位置始终一致，可以佐证，同时可以看看定向合成的杂质与API中的杂质紫外吸收是否一致，加上LC-MS定位的分子量与定向合成的分子量一致，那就基本上可以确定是一致的。

通过分析得出一种结构，然后通过不同的反应方式合成得到所需要的结构，HPLC和该杂质出峰时间和相对保留时间一致，不足以说明合成的杂质就是该API的杂质。因为有些时候不同的两个结构概率很低的会出现仙童的保留时间，但是这种情况概率很低。

既然你能通过分析手段推出该结构的可能情况，同时保留时间又一样，可以说明合成的杂质就是该API的杂质。