2019-11-10 18:11:39

大量重复序列是否会影响测序结果?

有一个基因序列,全长1200bp左右,其中有一个40bp的重复序列,在该基因内部重复出现了8次,但是两次测序结果不一致,其中一次测序缺失了一个完整的重复,即内部重复只出现了7次,希望向各位高手咨询一下,造成这个情况的原因是测序的问题还是T克隆的问题呢?谢谢。


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5个回答

有种现象就叫做 copy number variation (CNV),其实这个值得研究下,目前已经发现不少疾病与CNV相关


2019-11-10 19:22:52

0bp一般不太可能是测序错误,有可能这个就是tandem dup的时间吧,在不同个体之间的差异性

2019-11-10 20:51:09

直接PCR一下,看看长度有没有变化


2019-11-10 21:01:43

测序结果都有峰图,建议看一下图,在差异位置峰值差异大不大就可以判断测序结果准不准了

2019-11-11 16:49:48

那得看你设计的引物落在哪个区域吧,是否报告了重复序列

2019-11-14 11:38:22

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