我一般就是先用MCI填料或活性炭脱色，再直接制备分离。要是你有液-质数据就可以协助你判断可否采用凝胶分离了。

极性大的东西除色素可以用这两年比较兴起的一种填料MCI比较好，除完色素你可以进一针液相看看有什么东西，从210，250，280，360这四个波段就可以大致推测你组分里的化合物类型，然后就可以用制备液相了，如果没有制备，就可以用开放的ODS柱，虽然麻烦，效率低一点，但是它的原理是和制备柱一样的，也可以用凝胶试一试，但千万要少用正相硅胶柱，因为极性大死吸附比较严重。

可以用ODS或者试试葡聚糖凝胶，不过记得一定上柱前要过滤膜，否则容易堵上。你也可以你测测pH值，也许会有提示，色素的话可以过一下活性炭，不过有损失。可以快速热抽滤，减少接触。总之多多尝试，会找到好办法的。

你试过将点板的样品进液相分析吗？在紫外末端附近看看明显有几个峰，这样可以协助你判断TLC上稍微拖尾的是不是另外的物质（有时是由于展开剂中PH不当造成的拖尾现象）。如果你确定需要分离原点的东西，可以试试开放性的反相填料或通过制备液相来分离。

不是很了解植物组分，但是觉得应该也是有机物，尝试一下爬大板分离或者反相色谱柱