我们有敲入CRE酶的老鼠,作基因鉴定时理论上敲入与未敲入应该是有不同位置的条带作区别,大小相差几十bp,在250bp左右的位置。但一直PCR后电泳出来,只有敲入的老鼠有条带,未敲入的老鼠都是看不到条带,百思不得其解啊,望有经验的前辈指点!步骤的话,粗提鼠尾DNA, 反应条件就是按的takara 热启动酶的推荐条件,94度变性,55退火,72延伸,跟说明书一模一样的。最后水平电泳。
可能未敲入鼠的DNA没有提取出来。 先证明未敲入鼠的DNA提取成功,如果证明提取成功了,再考虑别的原因。
看看引物设计是否有问题,也许是刚好某段引物设计在插入区,野生型没有该段序列所以P不出来呢?
退火温度呢?是文献支持的么,这两个退火温度可能不一样。