如何研究一种化学物在细胞中的pathway？

打算研究一种化学物在细胞中的pathway,因为没有现成研究出来的通路，知道最好用表达谱基因芯片，但是数据量太大，所以想做功能分类表达谱，比如做个凋亡通路的，但是不知道只做凋亡通路有意义吗？或者说我的目的是想找低剂量药物的biomarker,最好是早期的一些基因变化？谢谢~

生物信息学

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这种筛选太过于片面化，细胞中的通路繁琐复杂而且相互之间又有连结交替，只做凋亡通路意味着最初就把凋亡通路隔离出来，肯定也会有一些变化，但是不能全面的看到这种变化，换个通路一样也可以筛选出变化，如何解释这种化学物质主要影响凋亡通路呢？如果能够全面筛选，最后经过差异基因参与的所有信号通路的网络分析找出核心变化的通路，进而锁定对应的基因，才是更全面更符合逻辑的一种思路！

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2024-04-04 15:11:25

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1.只做凋亡倒是可以的。逻辑思维：现象到本质。如果你打了药，发现的现象是只有凋亡的的确确变化了，那你可以把你的研究集中在apoptosis。但是这样肯定不够全面了，兄弟，你表达谱这么贵的实验都做了，应该充分利用你的big data比较合算。
2.找低剂量早期的biomarker，那你就多做几个组，浓度从高到低，时间从高到低，一比较就出来了

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2024-04-04 15:12:46

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