2024-04-15 16:53:10

如何对点突变对基因功能影响预测?

做Tilling,最近获得了一批点突变体。这些突变体是同一个基因不同位点上单碱基的变异,该基因序列已知,如何对这些碱基变异对基因功能的影响做预测。望高手指点

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3个回答

纯理论的方法很难......

还是要实验。

2024-04-15 22:01:32

可以从翻译后修饰入手试试。首先看snp是否会影响到蛋白质序列,如果可以,再看原位点或附近有没有修饰位点,着重看磷酸化,毕竟磷酸化功能方面做的比较多。有可能会发生位点或附近位点磷酸化位点的缺失。具体做法楼主有兴趣再回复吧。

2024-04-16 01:30:54

我有个建议(不知对不对):第一步,把已知DNA转换成protein;第二步,确定单碱基的变异造成的SAP;第三步,从PDB库search此protein序列,得到结构(有的有,有的没有);第四步,用Swiss-PDBViewer等软件分析此SAP对结构带来的变化;第五步,通过文献搜索估计此结构变化对功能的影响。


2024-04-16 01:32:23

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